Этот мультипликационный сериал основан на популярном фильме под таким же названием. В далеком будущем для регулирования, контроля и патрулирования инопланетной иммиграции была создана секретная правительственная организация «Люди в черном». Благодаря внедрению сверхновых технологий этой организации долгое время удается хранить свою деятельность в строжайшем секрете от других жителей Земли. А работают в этой организации суперагенты-профессионалы, такие, как Джей и Кей. Они одеты в спецодежду строгого черного цвета, которому подчинены и костюм, и туфли, и галстук, и даже очки.

Сюжет каждой из серий этого увлекательного приключенческого сериала знакомит зрителя с расследованием очередного задания, поставленного перед доблестными агентами. В каждой серии им противостоят коварные пришельцы из других миров. Но для настоящих агентов нет ничего проще, чем остановить разбушевавшегося монстра или вывести на чистую воду хитрого маньяка, принявшего человеческий облик. Агенты знают практически все о повадках космических злоумышленников, а тем остается лишь признать, что во всей Вселенной нет агентов круче, нежели друзья-напарники Джей и Кей.